1.数据完全掌握在自己手里。
小程序作为微信功能的延伸，核心用户数据掌握在微信手中，企业无法直接接触。手机App属于自己的平台，所有数据都是自己掌控的。对于客户分析、营销分析等非常方便。还可以直接推送消息，给客户发短信，优势明显。
2.强大的功能
小程序的功能完全受限于微信，微信的开放功能很少，而且小程序的内存大小有限，无法实现复杂的功能。微信为了控制小程序，维护自己的社交体系，拒绝小程序过多的营销，对内容和功能有很强的限制。App的功能可以自由选择开发。
3.访问速度快。
native App的大部分功能都可以在手机上交互访问，只有在需要访问数据库服务器时，才可以通过网络对外交互。但是小程序的大部分内容都需要重新加载，所以访问速度比较慢。
4.良好的用户体验
App可以根据用户的使用习惯进行更加个性化的设置，实现更加多样化的交互体验。对网络的要求不高，各种功能满足用户需求，而小程序的功能、内容、风格都很简单，加载很慢。
5.您可以缓存资源。
手机的一大特点是可以缓存资源，如新闻、图片、小说、视频、音频等。尤其是阅读产品和在线教育产品，用户本身就有下载和缓存的需求，可以反复查看和学习。对缓存的要求非常高。这个时候小程序几乎就不值钱了。
而且，现在手机配置越来越高，微信小程序取代手机app的难度会越来越大——足够高的配置会让用户越来越难在意几十兆的差距，网速的上升，网络流量价格的下降。
6.不存在被腾讯控制的风险。
小程序流量一旦起来，非常容易触发微信协议，非常模糊。微信自己的产品和第三方产品的待遇完全不同。腾讯自己的小程序也可以用同样的功能，但是很多不知道怎么直接用，会被腾讯直接屏蔽，没有任何预警和后期申诉。
对于企业来说，如果把所有的线上业务都寄托在小程序上，这种模糊的指引和严重的封杀所造成的损失显然是无法承受的。
7.使用路径更短
小程序依赖微信。当你真的想用的时候，你会发现很难找到。需要打开微信，在小程序列表中寻找。但是大部分小程序都淹没在列表中，用户可以很快发现都是常用游戏。手机App在用户手机桌面，用户每天都能看到，打开就能直接使用。安卓手机虽然可以在桌面添加小程序，但是比例并不高。从摩拜单车也可以看出，虽然有摩拜单车小程序，但是使用路径比较深，每次使用都需要重新加载，相比App效率明显较低。